Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms