Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim41Q5NCC3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms