Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8M2

Odf3b, Outer dense fiber protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3bQ5M8M2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Odf3bQ5M8M2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms