Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms