Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3lQ4KL14 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms