Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm10488Q4KL05 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms