Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp953Q3UPV7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp953Q3UPV7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms