Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms