Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms