Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Q3U6N9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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