Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q3U595 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q3U595 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q3U595 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q3U595 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q3U595 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q3U595 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q3U595 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q3U595 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q3U595 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q3U595 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Q3U595 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q3U595 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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