Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms