Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms