Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms