Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms