Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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Shroom4Q1W617 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shroom4Q1W617 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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Shroom4Q1W617 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms