Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ttc39dQ0VF76 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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