Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm1Q0GA42 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms