Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms