Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms