Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms