Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms