Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms