Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms