Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms