Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms