Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms