Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AlkP97793 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AlkP97793 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AlkP97793 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AlkP97793 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms