Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprn2P80560 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms