Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tp53bp1P70399 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tp53bp1P70399 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tp53bp1P70399 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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