Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms