Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfixP70257 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfixP70257 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfixP70257 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms