Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms