Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps4xP62702 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps4xP62702 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms