Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmc5P62196 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms