Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms