Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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