Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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