Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms