Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms