Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms