Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmoP56726 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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