Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf5P56477 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf5P56477 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms