Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms