Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff3P51827 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff3P51827 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms