Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpbP50405 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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