Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtshP49935 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtshP49935 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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