Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CitP49025 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CitP49025 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CitP49025 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms