Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VdrP48281 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VdrP48281 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VdrP48281 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VdrP48281 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VdrP48281 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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