Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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SrprbP47758 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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SrprbP47758 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms